Esteban Muñoz Herrera werd geboren in Valdivia (Chili). Hij studeerde theaterwetenschappen aan de Ludwig Maximilians Universiteit en dramaturgie aan de August Everding Theateracademie in München.
Hij werkte samen met regisseurs als Calixto Bieito, Barrie Kosky, Emilio Sagi en Balázs Kovalik en heeft in opgetreden in talrijke operahuizen, onder meer in Keulen, Zürich, Lausanne, Amsterdam, Barcelona, Chicago, Houston, Santiago de Chile alsook op de Salzburger Festspiele.
Sinds 2011 heeft hij een nauwe artistieke samenwerking met Carlus Padrissa en La Fura dels Baus. Samen ontwikkelden ze producties als Die Soldaten (Oper Köln), Elektra (Norrlands Operan), Der Ring des Nibelungen (Houston en Taichung), Karl V. (Bayerische Staatsoper), en Der Freischütz (Konzerthaus Berlijn).
In Chili regisseerde hij het toneelstuk Cariño malo van Inés Margarita Stranger, het oratorium 1850 van Luis Advis, en creëerde hij de shows Divas del cine en Los viudos de Marilyn voor popzanger Paz Court.
Van 2016 tot 2023 was hij aangesteld als regisseur bij de Komische Oper Berlin, waar hij verantwoordelijk was voor de semi-geënsceneerde uitvoeringen van Paul Abrahams operettes Dschainah en Die Blume von Hawaii, evenals de Duitse première van Shakespeare’s A Midsummer Nights Dream met de theatervoorstellingmuziek van Astor Piazolla.
In 2013 ontving hij de ProArte-prijs als jonge kunstenaar van het jaar in Chili.